国立科学博物馆是日本最大的自然科学博物馆，馆内收藏和展出日本古代历史文物和美术珍品共10多万件，包括了雕刻、染织、刀剑、陶瓷、建筑、绘画、漆工、书道等历史文物，是日本最大的自然科学博物馆。

    整座博物馆的建筑和内部装饰很有西洋特色，彩色花纹的玻璃窗，欧式复古的吊灯作为灯光照明，墙壁的雕刻与装饰，大理石的台阶与墙壁。

    从博物馆布局来看，从地下3层至地上3层，展馆主题分别为：宇宙、物质、法则馆——地球环境的变动和生物的进化(诞生和灭绝的不可思议)——地球环境的变动和生物的进化(探索恐龙之谜)——地球上多种的生物——科学和技术发展的过程——在大地上纵横驰骋的生命。